Başbuğ, "Sizce Fenerbahçe kumpasa uğradı mı" sorusu üzerine ise şunları söyledi: "Mahkeme kumpas dedi, komplo dedi. İnşallah Yargıtay'da kısa bir sürede sonuçlanır. Niye Fenerbahçe? Çünkü Fenerbahçe Türkiye'nin en büyük sivil toplum örgütü. Üye sayısına bakıldığında en büyüğü Fenerbahçedir. Şu andaki Fenerbahçe başkanı konuşmalarıyla Cumhuriyet'e ve Atatürk'e diğerlerine nazaran en fazla sahip çıkan bir kişiliğe sahip, bu da bir gerçektir."
İlker Başbuğ'a Ergenekon ve Balyoz davasının Türk Silahlı Kuvvetleri'nin motivasyonunda bir değişikliğe neden olup olmadığı soruldu. Her iki komplonun da TSK'nın motivasyonunu azaltmadığını söyleyen Başbuğ, "Bunu da somut göstergesi ile anlatıyoruz. Bundan bir iki ay evvel GATA'ya ziyarete gittik. Teğmen çenesinden vurulmuş bir şey söylemeye çabalıyor. Arkadan doktorlar 'konuşma' diyorlar. Bana söylediği cümle şuydu 'Komutanım ben buradayım. Çatışmadaki arkadaşlarımı yalnız bıraktım. Üzülüyorum' diyor. İşte Türk askeri budur" ifadelerini kullandı.
Konferans sonunda Emekli Orgeneral İlker Başbuğ'a anı plaketi ve çiçek takdim edildi.